海神廟位於台東市富岡漁港北側的富岡新村內,村內地勢拔高,是海岸階地。海神廟面向太平洋,傍晚時可以望見海面上歸航的漁船緩緩駛過,劃破萬點鱗波。

海神廟主神如意娘娘,原為大陳漁山島娘娘廟所供奉之主神,民國四十四年二月大 陳島上軍民全數撤退來台時,漁山島上居民也將娘娘廟的神明與附近廟宇的神明全數裝箱隨船搬運來台。來台後,由政府安置先居住於台東縣興昌一帶,民國四十五年遷入富岡國小旁,自成村落,在此期間,眾神明均暫置民宅供善信參拜。民國五十四年聚資建廟,眾神明才有正式安置處。民國五十九年時空軍建富岡基地、海神廟首當其衝,全村乃又搬遷到現址,現址的海神廟也是當時由空軍建還。因是由空運建造,廟的全盤功能性考量反較民間周延,海神廟因禍得福,澤及百姓。